Невозможно точно определить год постройки корабля. Профессор Ароннакс находит в библиотеке корабля книгу Жозефа Бертрана «Основы астрономии», изданную в 1865 году, из чего делает вывод, что «Наутилус» был построен не раньше 1865 года.

В романе «Таинственный остров» указывается, что «Наутилус» был построен после окончания восстания сипаев, то есть не раньше 1859 года, а к моменту попадания колонистов на остров Немо провёл там уже 6 лет.

Получается, что «Наутилус» встал «на прикол» уже в 1859 году, а в 1865 он был заперт в пещере.

Из этого следует, что корабль проплавал в океане меньше года, а сам Немо провёл на нём всего 9 лет, что гораздо меньше 30 лет, которые называл инженер Сайрес Смит.

Указанные явные противоречия вызваны тем, что в романах, где фигурирует «Наутилус», приведены принципиально не согласуемые датировки:

  • В «20 000 льё под водой» действие происходит в 1867—1868 году, капитан Немо — в расцвете сил, экипаж «Наутилуса» ещё достаточно многочисленный.
  • В «Таинственном острове» действие происходит в то же самое время — в 1865—1869 годах. Но капитан Немо — уже старик (в конце книги ему около 70 лет), все его товарищи давно мертвы, «Наутилус» заперт в пещере. При этом Смит ссылается на сюжет «20 000 лье под водой» как на давнюю, хорошо известную историю. Интересно, что в истории жизни капитана Немо, рассказанной колонистам, приводятся даты, соответствующие «20 000 льё под водой», хотя они противоречат хронологии данной книги.

Противоречия можно снять только одним путём — «передвинув» сюжет второго романа в будущее на 30 лет. Но тогда станет невозможной привязка к гражданской войне в США.